持統天皇が治世8年（694）に、飛鳥浄御原宮から遷都、文武天皇を経て、元明天皇が平城京へ遷都する和銅3年（710）までの16年間の都がおかれていた。

都の名称は『日本書紀』に「新益京（あらましのみやこ）」と記され、『万葉集』には、藤原宮は大和三山に囲まれた地にあったと記される。